Workflow for health-related and brain data lifecycle

Abstract

Špatný životní styl může vést k chronickým onemocněním a nízké fyzické a duševní kondici. Předem však můžeme změřit a analyzovat více aspektů fyzického a duševního zdraví, jako jsou tělesné parametry, rizikové faktory zdraví, stupeň motivace a celková ochota změnit současný životní styl. Ve spojení s údaji reprezentujícími činnost lidského mozku můžeme získat a přesněji identifikovat zdravotní problémy člověka vyplývající z dlouhodobého životního stylu a případně zlepšit kvalitu a délku lidského života. V současné době se údaje týkající se mozku a fyzického zdraví běžně neshromažďují a nevyhodnocují společně. Předpokládá se však, že to bude zajímavý a životaschopný koncept, zejména pokud bude následovat podrobnější definice a popis celého cyklu jejich zpracování. Pokud se navíc při ukládání, anotování, analýze a vyhodnocování takovýchto souborů dat použijí osvědčené postupy, usnadní se tím nezbytný rozvoj infrastruktury a intenzivnější spolupráce mezi vědeckými týmy a laboratořemi. Tento přístup také zlepšuje reprodukovatelnost experimentální práce. Výsledkem je, že rozsáhlé sbírky dat týkajících se fyzického zdraví a zdraví mozku by mohly poskytnout spolehlivý základ pro lepší interpretaci celkového zdravotního stavu člověka. Cílem této práce je podat přehled a reflektovat některé osvědčené postupy používané v rámci světových komunit k zajištění reprodukovatelnosti experimentů, shromážděných souborů dat a souvisejících pracovních postupů. Tyto osvědčené postupy se týkají např. modelů životního cyklu dat, zásad FAIR a definic a implementací terminologií a ontologií. Dále je uveden příklad, jak by mohl být vytvořen automatizovaný systém pracovních postupů na podporu shromažďování, anotování, ukládání, analýzy a publikování výsledků. K realizaci koncepce takového automatizovaného systému pracovních postupů byl vyvinut pilotní systém Body in Numbers, který rovněž využívá osvědčené postupy softwarového inženýrství. Je jedinečný právě díky kombinaci zpracování a vyhodnocování tělesných a mozkových (elektrofyziologických) dat. Jeho implementace je podrobněji zkoumána a jsou diskutovány možnosti využití získaných poznatků a výsledků v různých aplikačních oblastech.