Title: A Standards Organization for Open and FAIR Neuroscience: the International Neuroinformatics Coordinating
Other Titles: Organizace standardů pro otevřenou a FAIR neurovědu: International Neuroinformatics Coordinating Facility
Authors: Abrams, Mathew Birdsall
Bjaalie, Jan G
Das, Samir
Egan, Gary F.
Ghosh, Satrajit S.
Goscinski, Wojtek J.
Grethe, Jeffrey S.
Kotaleski, Jeanette Hellgren
Wei Ho, Eric Tatt
Kennedy, David N.
Lanyon, Linda J.
Leergaard, Trygve B.
Mayberg, Helen S.
Milanesi, Liciano
Mouček, Roman
Poline, J. B.
Roy, Prasun K.
Strother, Stephen C.
Tang, Tong Boon
Tiesinga, Paul
Wachtler, Thomas
Wójcik, Daniel K.
Martone, Maryann E.
Citation: ABRAMS, MB. BJAALIE, JG. DAS, S. EGAN, GF. GHOSH, SS. GOSCINSKI, WJ. GRETHE, JS. KOTALESKI, JH. WEI HO, ET. KENNEDY, DN. LANYON, LJ. LEERGAARD, TB. MAYBERG, HS. MILANESI, L. MOUČEK, R. POLINE, JB. ROY, PK. STROTHER, SC. TANG, TB. TIESINGA, P. WACHTLER, T. WÓJCIK, DK. MARTONE, ME. A Standards Organization for Open and FAIR Neuroscience: the International Neuroinformatics Coordinating. Neuroinformatics, 2022, roč. 20, č. 1, s. 25-36. ISSN: 1539-2791
Issue Date: 2022
Publisher: Springer
Document type: článek
article
URI: 2-s2.0-85099813967
http://hdl.handle.net/11025/50517
ISSN: 1539-2791
Keywords: neuroinformatika,;tandardy a osvědčené postupy;FAIR principy;rganizace standardů;eurovědy;INCF;proces schvalování v INCF
Keywords in different language: neuroinformatics;standards and best practices;AIR principles, standards organization;Neuroscience;INCF;INCF endorsement process
Abstract: Velká potřebnost koordinace standardů a osvědčených postupů v neurovědách souvisí s úsilím o to, aby se neurovědy staly disciplínou zaměřenou na data. Globální iniciativy a projekty ve výzkumu mozku jsou připraveny generovat obrovské množství neurovědeckých dat. Zároveň se neurovědy, stejně jako mnohé domény v biomedicíně, potýkají s otázkami transparentnosti, přesnosti a reprodukovatelnosti. Široce používané a validované standardy a osvědčené postupy jsou klíčem k řešení výzev ve výzkumu, který využívá velká i malá data, protože tyto standardy a postupy jsou nezbytné pro integraci různých dat a pro rozvoj robustní, efektivní a udržitelné infrastruktury podporující otevřené a reprodukovatelné neurovědy. Vypracování komunitních standardů a jejich přijetí je však obtížné. Současná situace se vyznačuje nedostatkem robustních, validovaných standardů a množstvím překrývajících se, nedostatečně rozvinutých, nevyzkoušených a nedostatečně využívaných standardů a osvědčených postupů. International Neuroinformatics Coordinating Facility (INCF), nezávislá organizace zaměřená na podporu sdílení dat prostřednictvím koordinace infrastruktury a standardů, nedávno zavedla formální proces pro hodnocení a schvalování komunitních standardů a osvědčených postupů podporující FAIR principy. Tím, že INCF formálně slouží jako standardizační organizace zaměřená na otevřené a FAIR neurovědy, pomáhá hodnotit, propagovat a koordinovat standardy a osvědčené postupy napříč neurovědami. Tento článek poskytuje přehled o tomto procesu a diskutuje o tom, jak můžou neurovědy těžit z existence specializované standardizačního orgánu.
Abstract in different language: There is great need for coordination around standards and best practices in neuroscience to support efforts to make neuroscience a data-centric discipline. Major brain initiatives launched around the world are poised to generate huge stores of neuroscience data. At the same time, neuroscience, like many domains in biomedicine, is confronting the issues of transparency, rigor, and reproducibility. Widely used, validated standards and best practices are key to addressing the challenges in both big and small data science, as they are essential for integrating diverse data and for developing a robust, effective, and sustainable infrastructure to support open and reproducible neuroscience. However, developing community standards and gaining their adoption is difficult. The current landscape is characterized both by a lack of robust, validated standards and a plethora of overlapping, underdeveloped, untested and underutilized standards and best practices. The International Neuroinformatics Coordinating Facility (INCF), an independent organization dedicated to promoting data sharing through the coordination of infrastructure and standards, has recently implemented a formal procedure for evaluating and endorsing community standards and best practices in support of the FAIR principles. By formally serving as a standards organization dedicated to open and FAIR neuroscience, INCF helps evaluate, promulgate, and coordinate standards and best practices across neuroscience. Here, we provide an overview of the process and discuss how neuroscience can benefit from having a dedicated standards body.
Rights: © authors
Appears in Collections:Články / Articles (KIV)
OBD

Files in This Item:
File SizeFormat 
Mouček a kol. Abrams2021_Article_AStandardsOrganizationForOpenA.pdf469,38 kBAdobe PDFView/Open


Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11025/50517

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.

search
navigation
  1. DSpace at University of West Bohemia
  2. Publikační činnost / Publications
  3. OBD