Název: | Citlivostní analýza metod identifikace haplotypů |
Další názvy: | The sensitivity analysis of haplotype identification methods |
Autoři: | Vonášek, Adam |
Vedoucí práce/školitel: | Houdová, Lucie |
Datum vydání: | 2014 |
Nakladatel: | Západočeská univerzita v Plzni |
Typ dokumentu: | bakalářská práce |
URI: | http://hdl.handle.net/11025/15258 |
Klíčová slova: | transplantace kostní dřeně;krvetvorné buňky;HLA;HLA typizace;alela;haplotyp;genotyp;Clarkův algoritmus;EM algoritmus |
Klíčová slova v dalším jazyce: | bone marrow transplantation;haematopoietic stem cells;HLA;HLA typing;allele;haplotype;genotype;Clark algorithm;EM algorithm |
Abstrakt: | Práce se zabývá citlivostní analýzou metod pro identifikaci haplotypů. V teoretické části jsou obsaženy základní poznatky o transplantaci krvetvorných buněk, reakcích imunitního systému na ni, informace o HLA ("Human leucocyte antigens") znacích, způsobech typizace HLA znaků, a teoretický rozbor metod identifikace haplotypů, tj. Clarkova, EM ("Expectation-Maximization") a Bayesova algoritmu. Praktická část je věnována implementaci dvou zvolených algoritmů v prostředí programovacího jazyka Java, jejich výsledkům a zhodnocení, co se týče předností a nedostatků, které jsme stanovili na základě implementace. Na konci práce se nachází výkladový slovník pojmů. |
Abstrakt v dalším jazyce: | The work deals with a haplotype identification methods sensitivity analysis. A theoretical section should provide basic facts about haematopoietic stem cells transplantation, following reactions of immune system, HLA ("Human leucocyte antigens") types, methods for typing and a theoretical analysis of the haplotype identification methods, i.e. Clark, Expectation-Maximization and Bayes algorithm. A practical section focuses on two elected methods implementation using the computer programming language Java, results and an evaluation on advantages and disadvantages derived by the implementation. There is a monolingual dictionary at the end of the work. |
Práva: | Plný text práce je přístupný bez omezení. |
Vyskytuje se v kolekcích: | Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY) |
Soubory připojené k záznamu:
Soubor | Popis | Velikost | Formát | |
---|---|---|---|---|
BP_Vonasek_15_5_2014.pdf | Plný text práce | 1,79 MB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
Vonasek-v.pdf | Posudek vedoucího práce | 3,93 MB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
Vonasek-p.pdf | Průběh obhajoby práce | 1,44 MB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam:
http://hdl.handle.net/11025/15258
Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.