| Název: | Nástroj pro detekci buněčných jader v mikroskopických histologických obrazech |
| Další názvy: | A tool for the detection of cell nuclei in microscopic histological images |
| Autoři: | Burian, Jan |
| Vedoucí práce/školitel: | Jiřík Miroslav, Ing. Ph.D. |
| Oponent: | Zítka Tomáš, Mgr. |
| Datum vydání: | 2022 |
| Nakladatel: | Západočeská univerzita v Plzni |
| Typ dokumentu: | bakalářská práce |
| URI: | http://hdl.handle.net/11025/49100 |
| Klíčová slova: | buněčná jádra;lékařství;konvoluční neuronové sítě;počítačové vidění;umělá inteligence;mask r-cnn;detectron2 |
| Klíčová slova v dalším jazyce: | cell nuclei;medicine;convolutional neural networks;computer vision;artificial intelligence;mask r-cnn;detectron2 |
| Abstrakt: | Tato bakalářská práce se věnuje vytvoření nástroje pro detekci buněčných jader v mikroskopických histologických obrazech, které byly obarveny barvením H&E. Při návrhu nástroje byl kladen důraz především na detekci jader jaterních buněk. Pomocí tohoto nástroje je rovněž možné natrénovat nové modely. Nástroj k predikci dat a trénování nových modelů využívá framework Detectron2, vytvořený organizací Facebook AI Research. Jako algoritmus pro detekci objektů byl zvolen algoritmus Mask R-CNN, který je součástí Detectronu2. Obecně bylo využito konvolučních neuronových sítí, jako jednoho z nástrojů počítačového vidění. Pro praktické využití nástroje byla vytvořena webová aplikace. Jako experiment bylo natrénováno šest modelů, které byly určeny přímo k detekci jaterních buněčných jader. |
| Abstrakt v dalším jazyce: | The main aim of this work is to develope a tool for the detection of cell nuclei in H&E microscopic histological images. When the tool was designed, it was mainly focused on the detection of liver cell nuclei. This tool can be also used for training new models. For the prediction and the training, the tool implements Detectron2 framework, which is developped by Facebook AI Research. As an object detection algorithm Mask R-CNN was chosen which is included in Detectron2. Basicly, the tool is based on the convolutional neural network, in this case neural network is used as one of the computer vision methods. Mainly for the practical usage of the tool, the web application was created. As an experiment the six models was trained for the detection of cell nuclei. |
| Práva: | Plný text práce je přístupný bez omezení |
| Vyskytuje se v kolekcích: | Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY) |
Soubory připojené k záznamu:
| Soubor | Popis | Velikost | Formát | |
|---|---|---|---|---|
| BP_final_Burian.pdf | Plný text práce | 13,86 MB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| Burian_V.pdf | Posudek vedoucího práce | 423,58 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| Burian_O.pdf | Posudek oponenta práce | 489,61 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| Burian_P.pdf | Průběh obhajoby práce | 223,11 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam:
http://hdl.handle.net/11025/49100Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.