| Title: | Vizualizace dělení prostoru v dynamických modelech makromolekul |
| Other Titles: | Space Partitioning Visualization in Dynamic Macromolecular Models |
| Authors: | Šťáva, Oto |
| Advisor: | Maňák Martin, Mgr. Ph.D. |
| Referee: | Hruda Lukáš, Ing. |
| Issue Date: | 2020 |
| Publisher: | Západočeská univerzita v Plzni |
| Document type: | bakalářská práce |
| URI: | http://hdl.handle.net/11025/41788 |
| Keywords: | voroného diagram;počítačová grafika;vizualizace;dělení prostoru;bézierova křivka;opengl;geometry shader;algoritmus de casteljau |
| Keywords in different language: | voronoi diagram;computer graphics;visualization;space partitioning;bézier curve;opengl;geometry shader;de casteljau algorithm |
| Abstract: | Modelování a vizualizace makromolekulárních struktur proteinů jsou důležitou součástí medicínské informatiky. Tyto vizualizace mohou experti v tomto oboru využívat ke hledání a zkoumání biologicky aktivních míst v těchto molekulách. Ke hledání dutin a tunelů, které mohou představovat možné přístupové cesty k těmto aktivním místům, jsou využívány algoritmy využívající dělení prostoru do Voroného diagramů. Tato práce se zabývá grafickou vizualizací aditivně vážených Voroného diagramů za účelem výzkumu chování těchto diagramů, a to zejména nad dynamickými modely molekul. Součástí práce je softwarová implementace této vizualizace v podobě rozšiřujícího modulu pro aplikaci CAVER Analyst. |
| Abstract in different language: | Modelling and visualization of macromolecular protein structures play an important part in medical informatics. These visualizations may be used by medical experts to search for and examine biologically active places in these molecules. Existing software solutions use algorithms based on analysis of space partitioning into Voronoi diagrams to find cavities and tunnels, which may be used as potential access paths to those active places. This thesis concerns graphical visualization of additively weighted Voronoi diagrams, which would allow further examination of their behaviour, particularly in dynamically changing molecule models. As a part of the thesis, an extension module for the software application CAVER Analyst visualizing these diagrams was implemented. |
| Rights: | Plný text práce je přístupný bez omezení. |
| Appears in Collections: | Bakalářské práce / Bachelor´s works (KIV) |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| BP_Oto_Stava_final.pdf | Plný text práce | 26,32 MB | Adobe PDF | View/Open |
| A16B0148P_Hodnoceni.pdf | Posudek vedoucího práce | 27,51 kB | Adobe PDF | View/Open |
| A16B0148P_Posudek.pdf | Posudek oponenta práce | 135,67 kB | Adobe PDF | View/Open |
| A16B0148P_Obhajoba.pdf | Průběh obhajoby práce | 82,38 kB | Adobe PDF | View/Open |
Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11025/41788Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.