| Title: | Analýza nástrojů a pipeline pro zpracování long-read sequencing dat |
| Authors: | Soukupová, Barbora |
| Advisor: | Houdová Lucie, Ing. Ph.D. |
| Referee: | Holubová Monika, Mgr. Ph.D. |
| Issue Date: | 2023 |
| Publisher: | Západočeská univerzita v Plzni |
| Document type: | bakalářská práce |
| URI: | http://hdl.handle.net/11025/55120 |
| Keywords: | dna sekvenování;long-read sekvenování;sekvenování nové generace;analýza long-read dat;nástroje pro analýzu dat;pipeline pro analýzu dat |
| Keywords in different language: | dna sequencing;long-read sequencing;next-generation sequencing;long-read data analysis;data analysis tools;data analysis pipeline |
| Abstract: | Long-read sekvenování je technologie, která způsobila revoluci v oblasti genomiky. Na rozdíl od dříve používaných sekvenačních technik, které dokážou přečíst pouze krátké úseky DNA, long-read sekvenování dokáže číst až desítky tisíc bází najednou, což poskytuje nový a komplexnější pohled na genom. Tato práce představuje principy long-read sekvenování a jeho výhody a nevýhody oproti jiným metodám sekvenování. Cílem této práce je poskytnout přehled dostupných nástrojů a pipeline, které jsou k dispozici pro analýzu dat z long-read sekvenování, a také shrnout současné aplikace. |
| Abstract in different language: | Long-read sequencing is a technology that has revolutionised the field of genomics. Unlike previously used sequencing techniques, which are able to read only short fragments of DNA, long-read sequencing can produce reads of tens of thousands of bases in length, providing a new and more comprehensive view of the genome. This thesis introduces the principles of long-read sequencing and its advantages and disadvantages over other sequencing methods. It provides an analysis of the tools and pipelines that are available for long-read sequencing data analysis as well as the current applications. |
| Rights: | Plný text práce je přístupný bez omezení |
| Appears in Collections: | Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY) |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| BP_Soukupova.pdf | Plný text práce | 4,85 MB | Adobe PDF | View/Open |
| PosudekOponentaSTAG.pdf | Posudek oponenta práce | 60,78 kB | Adobe PDF | View/Open |
| PosudekVedoucihoSTAG.pdf | Posudek vedoucího práce | 61,18 kB | Adobe PDF | View/Open |
| Prubeh obhajoby Soukupova.pdf | Průběh obhajoby práce | 80,12 kB | Adobe PDF | View/Open |
Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11025/55120Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.