Full metadata record
DC poleHodnotaJazyk
dc.contributor.advisorJiřík Miroslav, Ing. Ph.D.
dc.contributor.authorBurian, Jan
dc.contributor.refereeVyskočil Jiří, Ing.
dc.date.accepted2024-6-19
dc.date.accessioned2024-07-12T09:02:13Z-
dc.date.available2023-10-2
dc.date.available2024-07-12T09:02:13Z-
dc.date.issued2024
dc.date.submitted2024-5-20
dc.identifier96346
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/55794-
dc.description.abstractHlavním tématem této diplomové práce je navržení a následná implementace metody pro extrakci jaterní mezibuněčné hmoty (extracelulárního matrixu) z mikroskopických histologických snímků. Navrženou metodu lze rozdělit do několika na sebe navazujících kroků. Nejprve dojde k segmentaci buněčných jader, následně dojde k jejich filtraci (metoda inpaintingu) s využitím binární masky získané ze segmentace. V závěrečné části se obraz s filtrovanými buněčnými jádry opět segmentuje, tentokrát však již segmentujeme mezibuněčnou hmotu. Pro potřebu zpracování mikroskopických obrazů jsme vyvinuli modul v jazyce Python, který umožňuje dané paměťově náročné obrazy zpracovávat po jednotlivých dlaždicích. V závěru práce jsme porovnali výsledky naší metodu s metodou založenou na generativních neuronových sítích, tzv. GANech a ověřili funkčnost navrženého řešení.cs
dc.format73 s.
dc.language.isocs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plzni
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení
dc.subjectumělá inteligencecs
dc.subjectlékařstvícs
dc.subjectmezibuněčná hmotacs
dc.subjecthistologiecs
dc.subjectfiltracecs
dc.subjectsegmentacecs
dc.titleExtrakce mezibuněčné hmoty z histologických mikroskopických snímků jater pomocí metod strojového učenícs
dc.title.alternativeExtraction of extracellular matrix from histological microscopic images of the liver using machine learning methodsen
dc.typediplomová práce
dc.thesis.degree-nameIng.
dc.thesis.degree-levelNavazující
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných věd
dc.thesis.degree-programKybernetika a řídicí technika
dc.description.resultObhájeno
dc.description.abstract-translatedThe main aim of this thesis is to design and implement a method for the extraction of extracellular matrix from microscopic histological images, also called whole slide images. The proposed method can be divided into several consecutive steps. First, the cell nuclei are segmented, then they are filtered (inpainting method) using the binary mask already obtained from the segmentation step. In the final part, the image with filtered cell nuclei is segmented again, but this time we segment the extracellular matrix. Because of the high memory requirements of microscopic images, we have developed a Python module that allows the given image to be processed one tile at a time. At the end, we focused on a comparison of the results of our method with a method based on generative neural networks, the so-called GAN and verified the functionality of the proposed method.en
dc.subject.translatedartificial intelligenceen
dc.subject.translatedmedicineen
dc.subject.translatedextracellular matrixen
dc.subject.translatedhistologyen
dc.subject.translatedfiltrationen
dc.subject.translatedsegmentationen
Vyskytuje se v kolekcích:Diplomové práce / Theses (KKY)

Soubory připojené k záznamu:
Soubor Popis VelikostFormát 
Diplomova_prace.pdfPlný text práce30,62 MBAdobe PDFZobrazit/otevřít
PosudekVedoucihoSTAG-JirikM-127321.pdfPosudek vedoucího práce59 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
PosudekOponentaSTAG-VyskocilJ-277954.pdfPosudek oponenta práce59,79 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
ProtokolSPrubehemObhajobySTAG.pdfPrůběh obhajoby práce39,83 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
Zobrazit minimální záznam Zobrazit statistiky


Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam: http://hdl.handle.net/11025/55794

Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.

hledání
navigace
  1. DSpace at University of West Bohemia
  2. Vysokoškolské kvalifikační práce / Theses
  3. Fakulta aplikovaných věd / Faculty of Applied Sciences
  4. Katedra kybernetiky / Department of Cybernetics
  5. Diplomové práce / Theses (KKY)