Full metadata record
DC poleHodnotaJazyk
dc.contributor.advisorHoudová Lucie, Ing. Ph.D.
dc.contributor.authorRottenbornová, Lucie
dc.contributor.refereeOstašov Pavel, Mgr. Ph.D.
dc.date.accepted2021-8-26
dc.date.accessioned2021-08-30T22:12:30Z-
dc.date.available2020-10-15
dc.date.available2021-08-30T22:12:30Z-
dc.date.issued2021
dc.date.submitted2021-8-16
dc.identifier86232
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/44977
dc.description.abstractBakalářská práce se zabývá identifikací alel MICA a MICB genů pro následné použití v rámci transplantce kostní dřeně. Cílem práce je seznámení se s významem genů MICA a MICB, porovnání sekvenačních metod, zejména Sangerovo sekvenování a Next-generation sekvenování (NGS), porozumění problematice identifikace alel a následný návrh metody pro automatickou identifikaci alel. Metoda byla vyvíjena na základě syntetických dat s vlastnostmi vycházejícími z reálných experimentů prováděných ve FN Plzeň. Kromě samotné metody realizované v jazyce Python za pomoci rozšíření Biopython je v práci popsán způsob získávání referenčních dat, vytváření syntetických dat a zhodnoceny výsledky ověřování metody.cs
dc.format85 s.cs
dc.language.isocscs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plznics
dc.relation.isreferencedbyhttps://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=86232-
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení.cs
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectbioinženýrstvícs
dc.subjectidentifikace genůcs
dc.subjectmicacs
dc.subjectmicbcs
dc.subjectsangerovo sekvenovánícs
dc.subjectsekvenování nové generacecs
dc.titleMetoda pro identifikaci MICA a MICB genůcs
dc.title.alternativeMICA and MICB Gene Identification Methoden
dc.typebakalářská prácecs
dc.thesis.degree-nameBc.cs
dc.thesis.degree-levelBakalářskýcs
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných vědcs
dc.thesis.degree-programInženýrská informatikacs
dc.description.resultObhájenocs
dc.rights.accessopenAccessen
dc.description.abstract-translatedThis bachelor thesis deals with the identification of alleles of MICA and MICB genes for subsequent use in bone marrow transplantation. The aim is to get acquainted with the importance of MICA and MICB genes in bone marrow transplant, comparison of sequencing methods, especially Sanger sequencing and Next-generation sequencing (NGS), understanding the problems of allele identification and subsequent design of method for automatic allele identification. The method was developed based on synthetic data with properties similar to real data from experiments performed at FN Plzeň. In addition to the method implemented in Python using the Biopython extension, the work describes the method of obtaining reference data, creating synthetic data and evaluating the results of verifying the method.en
dc.subject.translatedbioinformaticsen
dc.subject.translatedbioengineeringen
dc.subject.translatedgene identificationen
dc.subject.translatedmicaen
dc.subject.translatedmicben
dc.subject.translatedsanger sequencingen
dc.subject.translatednext-generation sequencingen
Vyskytuje se v kolekcích:Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY)

Soubory připojené k záznamu:
Soubor Popis VelikostFormát 
Dokumentace_Rottenbornova_Lucie.pdfPlný text práce1,63 MBAdobe PDFZobrazit/otevřít
rottenbornova-v.pdfPosudek vedoucího práce358,01 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
rottenbornova-o.pdfPosudek oponenta práce817,95 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
rottenbornova-p.pdfPrůběh obhajoby práce177,35 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
BP_el_verze_Rottenbornova_Lucie.zipVŠKP - příloha5,09 MBZIPZobrazit/otevřít
Zobrazit minimální záznam Zobrazit statistiky


Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam: http://hdl.handle.net/11025/44977

Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.

hledání
navigace
  1. DSpace at University of West Bohemia
  2. Vysokoškolské kvalifikační práce / Theses
  3. Fakulta aplikovaných věd / Faculty of Applied Sciences
  4. Katedra kybernetiky / Department of Cybernetics
  5. Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY)