| Název: | Metoda pro identifikaci MICA a MICB genů |
| Další názvy: | MICA and MICB Gene Identification Method |
| Autoři: | Rottenbornová, Lucie |
| Vedoucí práce/školitel: | Houdová Lucie, Ing. Ph.D. |
| Oponent: | Ostašov Pavel, Mgr. Ph.D. |
| Datum vydání: | 2021 |
| Nakladatel: | Západočeská univerzita v Plzni |
| Typ dokumentu: | bakalářská práce |
| URI: | http://hdl.handle.net/11025/44977 |
| Klíčová slova: | bioinformatika;bioinženýrství;identifikace genů;mica;micb;sangerovo sekvenování;sekvenování nové generace |
| Klíčová slova v dalším jazyce: | bioinformatics;bioengineering;gene identification;mica;micb;sanger sequencing;next-generation sequencing |
| Abstrakt: | Bakalářská práce se zabývá identifikací alel MICA a MICB genů pro následné použití v rámci transplantce kostní dřeně. Cílem práce je seznámení se s významem genů MICA a MICB, porovnání sekvenačních metod, zejména Sangerovo sekvenování a Next-generation sekvenování (NGS), porozumění problematice identifikace alel a následný návrh metody pro automatickou identifikaci alel. Metoda byla vyvíjena na základě syntetických dat s vlastnostmi vycházejícími z reálných experimentů prováděných ve FN Plzeň. Kromě samotné metody realizované v jazyce Python za pomoci rozšíření Biopython je v práci popsán způsob získávání referenčních dat, vytváření syntetických dat a zhodnoceny výsledky ověřování metody. |
| Abstrakt v dalším jazyce: | This bachelor thesis deals with the identification of alleles of MICA and MICB genes for subsequent use in bone marrow transplantation. The aim is to get acquainted with the importance of MICA and MICB genes in bone marrow transplant, comparison of sequencing methods, especially Sanger sequencing and Next-generation sequencing (NGS), understanding the problems of allele identification and subsequent design of method for automatic allele identification. The method was developed based on synthetic data with properties similar to real data from experiments performed at FN Plzeň. In addition to the method implemented in Python using the Biopython extension, the work describes the method of obtaining reference data, creating synthetic data and evaluating the results of verifying the method. |
| Práva: | Plný text práce je přístupný bez omezení. |
| Vyskytuje se v kolekcích: | Bakalářské práce / Bachelor´s works (KKY) |
Soubory připojené k záznamu:
| Soubor | Popis | Velikost | Formát | |
|---|---|---|---|---|
| Dokumentace_Rottenbornova_Lucie.pdf | Plný text práce | 1,63 MB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| rottenbornova-v.pdf | Posudek vedoucího práce | 358,01 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| rottenbornova-o.pdf | Posudek oponenta práce | 817,95 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| rottenbornova-p.pdf | Průběh obhajoby práce | 177,35 kB | Adobe PDF | Zobrazit/otevřít |
| BP_el_verze_Rottenbornova_Lucie.zip | VŠKP - příloha | 5,09 MB | ZIP | Zobrazit/otevřít |
Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam:
http://hdl.handle.net/11025/44977Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.